La tecnología Biospyder ayuda a realizar el análisis genómico avanzado en el ámbito de la investigación biomédica aportando soluciones procedimentales y de resultados muy ventajosas para el trabajo de los laboratorios.
¿Cómo ayuda la tecnología Biospyder al análisis genómico avanzado en investigación biomédica?
La transcriptómica es una herramienta fundamental para comprender cómo se expresan los genes en diferentes procesos biológicos y enfermedades. Sin embargo, en la actualidad muchos estudios se ven limitados por la escasa cantidad de muestras que hay disponibles o por la degradación que sufre el material biológico. En este contexto, el sufrimiento y la aplicación de la tecnología de BioSpyder está transformando la investigación biomédica gracias a su alta sensibilidad y a su capacidad para trabajar con muestras complejas.
En Durviz la conocemos bien, de ahí que hayamos querido dedicar este post a esta nueva tecnología que está revolucionando el trabajo en investigación.
¿Cómo ayuda la tecnología BioSpyder al análisis genómico avanzado en investigación biomédica?
BioSpyder permite realizar estudios transcriptómicos de gran precisión, facilitando con ello el análisis de la expresión génica y la identificación de biomarcadores relevantes para la investigación y la medicina de precisión. Su tecnología ayuda a obtener resultados fiables incluso en proyectos complejos, lo que le lleva a diferenciarse de otras soluciones que hay en el mercado.
¿Por qué BioSpyder destaca en los estudios de transcriptómica?
Una de las principales ventajas de Biospider es su capacidad para detectar genes infraexpresados que pueden pasar desapercibidos con otras metodologías de trabajo. Esto proporciona una visión más completa de los mecanismos moleculares implicados en distintas patologías y de los procesos biológicos.
BioSpyder destaca en transcriptómica gracias a su plataforma TempO-Seq, una tecnología de secuenciación dirigida que simplifica el perfilado de expresión génica al eliminar la necesidad de extracción de ARN, transcripción inversa o preamplificación. Además, permite agrupar hasta 6.144 muestras en una sola secuenciación (gracias a sus códigos de barras cortos), reduciendo drásticamente los costes y el tiempo de bioinformática.
¿Cómo reduce BioSpyder los sesgos en el análisis de la expresión génica?
La tecnología BioSpyder minimiza los sesgos asociados a los procesos convencionales de extracción de ácido ribonucleico (ARN) y de retrotranscripción. Así pues, gracias a ello, los investigadores obtienen datos más representativos y reproducibles, mejorando así la calidad de los estudios transcriptómicos que realizan.
De nuevo su tecnología TempO-Seq es la que evita los sesgos de extracción y transcripción inversa mediante la hibridación y ligación de sondas directamente sobre el ARN de la muestra.
¿Es posible trabajar con cantidades muy pequeñas de muestra?
Sí. BioSpyder ofrece un excelente rendimiento utilizando cantidades mínimas de material biológico, una ventaja especialmente importante en los ámbitos de la investigación oncológica y en todo tipo de estudios donde las muestras son limitadas. Otra vez la clave de esto se encuentra en la tecnología TempO-Seq que se ha diseñado específicamente para maximizar el uso de muestras limitadas o de difícil acceso. De hecho, en Durviz sabemos que Biospider permite trabajar con cantidades de ARN total de menos de 10 pg e incluso directamente desde células individuales, sin requerir amplificación previa ni conversión a ADNc.
¿Qué ocurre con las muestras difíciles o degradadas?
La tecnología funciona eficazmente con muestras FFPE (las que emplean tejidos fijados en formol e incluidos en parafina) porque mantienen su perfil de expresión genética con alta precisión y reproducibilidad.
De hecho, las principales características y ventajas al procesar este tipo de muestras incluyen:
- No requiere transcripción inversa tradicional. Y es que al basarse en la unión de oligos detectores altamente sensibles que se hibridan directamente al ARN (sin necesidad de crear ADNc de longitud completa ni amplificación previa), se evitan los sesgos típicos de otras técnicas en muestras degradadas.
- Facilitan la compatibilidad con FFPE antiguo. Así, podemos afirmar que funciona de manera robusta en tejidos fijados en formalina e incluidos en parafina (FFPE) incluso con más de 27 años de antigüedad.
- Presenta resistencia a la fragmentación. Dado que los fragmentos diana a amplificar son muy cortos (aprox. 187 bp), se reduce enormemente el fallo de secuenciación por fragmentación del ARN.
- Cuenta con biomarcadores estables. Por ello, aunque exista degradación, los perfiles de expresión de múltiples genes se correlacionan fuertemente con muestras frescas, lo que permite aprovechar muestras clínicas o forenses de archivo.
Esto es especialmente importante ya que este tipo de muestras son muy utilizadas en anatomía patológica y en biobancos. De ahí que su uso amplíe las posibilidades de investigación.
¿Qué papel desempeña Durviz en la incorporación de esta tecnología?
Durviz pone a disposición de hospitales y centros de investigación soluciones avanzadas como BioSpyder, ayudando con ello a impulsar proyectos de transcriptómica con mayor sensibilidad, precisión y aprovechamiento de muestras complejas.