Descripción
GenX Pro.-16S rRNA V3-V4 Microbiome-Seq Kit
Kit de preparación de librerías para análisis de microbioma
Los estudios metagenómicos se realizan habitualmente analizando el gen procariota 16S del ARN ribosómico (ARNr), que tiene una longitud aproximada de 1.500 pb y contiene nueve regiones variables intercaladas entre regiones conservadas. Las regiones variables del gen 16S rRNA se utilizan con frecuencia en clasificaciones filogenéticas como género o especie en diversas poblaciones microbianas.
El GenXPro 16S rRNA-Seq Metagenomic Library Preparation Kit está diseñado para preparar bibliotecas de amplicones multiplexadas que abarcan el dominio hipervariable V3 – V4 del gen 16S rRNA microbiano. Estas bibliotecas son compatibles con la secuenciación de doble índice por pares en la plataforma Illumina MiSeq.
Características:
- Cobertura de la región completa V3 y V4 del gen 16s rRNA
- Basta con 0,1 ng de ADN bacteriano
- Sólo 1 h de preparación, tiempo total de preparación 3 h
- Sólo dos pasos de PCR, sin necesidad de purificación tras la primera PCR
- Altamente multiplexable: 384 códigos de barras disponibles
- Secuenciación 2x 300 bps con instrumentos Illumina MiSeq o NextSeq
- Bioinformática opcional incluida: análisis de la diversidad del metagenoma, clasificación taxonómica
Flujo de trabajo:
Principio y procedimiento:
En la preparación de bibliotecas metagenómicas de ARNr 16S intervienen dos pasos principales: una amplificación PCR inicial utilizando cebadores PCR personalizados dirigidos al dominio V3 y V4, y una amplificación PCR posterior que integra los adaptadores de secuenciación con índices de muestra únicos.
